| 1 | /* | 
|---|
| 2 | * Project: MoleCuilder | 
|---|
| 3 | * Description: creates and alters molecular systems | 
|---|
| 4 | * Copyright (C)  2010-2012 University of Bonn. All rights reserved. | 
|---|
| 5 | * | 
|---|
| 6 | * | 
|---|
| 7 | *   This file is part of MoleCuilder. | 
|---|
| 8 | * | 
|---|
| 9 | *    MoleCuilder is free software: you can redistribute it and/or modify | 
|---|
| 10 | *    it under the terms of the GNU General Public License as published by | 
|---|
| 11 | *    the Free Software Foundation, either version 2 of the License, or | 
|---|
| 12 | *    (at your option) any later version. | 
|---|
| 13 | * | 
|---|
| 14 | *    MoleCuilder is distributed in the hope that it will be useful, | 
|---|
| 15 | *    but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of | 
|---|
| 16 | *    MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the | 
|---|
| 17 | *    GNU General Public License for more details. | 
|---|
| 18 | * | 
|---|
| 19 | *    You should have received a copy of the GNU General Public License | 
|---|
| 20 | *    along with MoleCuilder.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>. | 
|---|
| 21 | */ | 
|---|
| 22 |  | 
|---|
| 23 | /* | 
|---|
| 24 | * \file RandomNumberDistribution_Encapsulation_impl.hpp | 
|---|
| 25 | * | 
|---|
| 26 | * Herein we place specializations of specific functions for specific distributions. | 
|---|
| 27 | * | 
|---|
| 28 | *  Created on: Jan 5, 2011 | 
|---|
| 29 | *      Author: heber | 
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| 30 | */ | 
|---|
| 31 |  | 
|---|
| 32 | // include config.h | 
|---|
| 33 | #ifdef HAVE_CONFIG_H | 
|---|
| 34 | #include <config.h> | 
|---|
| 35 | #endif | 
|---|
| 36 |  | 
|---|
| 37 | #include "CodePatterns/MemDebug.hpp" | 
|---|
| 38 |  | 
|---|
| 39 | #include <limits> | 
|---|
| 40 |  | 
|---|
| 41 | #include "RandomNumberDistribution_Encapsulation.hpp" | 
|---|
| 42 |  | 
|---|
| 43 | /* =========  manipulatedclone() ================ */ | 
|---|
| 44 |  | 
|---|
| 45 | template <> | 
|---|
| 46 | RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::uniform_smallint<> >:: | 
|---|
| 47 | RandomNumberDistribution_Encapsulation (const RandomNumberDistribution_Parameters&_params) : | 
|---|
| 48 | distribution_type(_params.min, _params.max) | 
|---|
| 49 | {} | 
|---|
| 50 |  | 
|---|
| 51 | template <> | 
|---|
| 52 | RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::uniform_int<> >:: | 
|---|
| 53 | RandomNumberDistribution_Encapsulation(const RandomNumberDistribution_Parameters&_params) : | 
|---|
| 54 | distribution_type(_params.min, _params.max) | 
|---|
| 55 | {} | 
|---|
| 56 |  | 
|---|
| 57 | template <> | 
|---|
| 58 | RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::uniform_real<> >:: | 
|---|
| 59 | RandomNumberDistribution_Encapsulation(const RandomNumberDistribution_Parameters&_params) : | 
|---|
| 60 | distribution_type(_params.min, _params.max) | 
|---|
| 61 | {} | 
|---|
| 62 |  | 
|---|
| 63 | template <> | 
|---|
| 64 | RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::bernoulli_distribution<> >:: | 
|---|
| 65 | RandomNumberDistribution_Encapsulation(const RandomNumberDistribution_Parameters&_params) : | 
|---|
| 66 | distribution_type(_params.p) | 
|---|
| 67 | {} | 
|---|
| 68 |  | 
|---|
| 69 | template <> | 
|---|
| 70 | RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::binomial_distribution<> >:: | 
|---|
| 71 | RandomNumberDistribution_Encapsulation(const RandomNumberDistribution_Parameters&_params) : | 
|---|
| 72 | distribution_type((int)_params.t, _params.p) | 
|---|
| 73 | {} | 
|---|
| 74 |  | 
|---|
| 75 | template <> | 
|---|
| 76 | RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::cauchy_distribution<> >:: | 
|---|
| 77 | RandomNumberDistribution_Encapsulation(const RandomNumberDistribution_Parameters&_params) : | 
|---|
| 78 | distribution_type(_params.median, _params.sigma) | 
|---|
| 79 | {} | 
|---|
| 80 |  | 
|---|
| 81 | template <> | 
|---|
| 82 | RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::gamma_distribution<> >:: | 
|---|
| 83 | RandomNumberDistribution_Encapsulation(const RandomNumberDistribution_Parameters&_params) : | 
|---|
| 84 | distribution_type(_params.alpha) | 
|---|
| 85 | {} | 
|---|
| 86 |  | 
|---|
| 87 | template <> | 
|---|
| 88 | RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::poisson_distribution<> >:: | 
|---|
| 89 | RandomNumberDistribution_Encapsulation(const RandomNumberDistribution_Parameters&_params) : | 
|---|
| 90 | distribution_type(_params.mean) | 
|---|
| 91 | {} | 
|---|
| 92 |  | 
|---|
| 93 | template <> | 
|---|
| 94 | RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::geometric_distribution<> >:: | 
|---|
| 95 | RandomNumberDistribution_Encapsulation(const RandomNumberDistribution_Parameters&_params) : | 
|---|
| 96 | distribution_type(_params.p) | 
|---|
| 97 | {} | 
|---|
| 98 |  | 
|---|
| 99 | template <> | 
|---|
| 100 | RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::triangle_distribution<> >:: | 
|---|
| 101 | RandomNumberDistribution_Encapsulation(const RandomNumberDistribution_Parameters&_params) : | 
|---|
| 102 | distribution_type(_params.a, _params.b, _params.c) | 
|---|
| 103 | {} | 
|---|
| 104 |  | 
|---|
| 105 | template <> | 
|---|
| 106 | RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::exponential_distribution<> >:: | 
|---|
| 107 | RandomNumberDistribution_Encapsulation(const RandomNumberDistribution_Parameters&_params) : | 
|---|
| 108 | distribution_type(_params.lambda) | 
|---|
| 109 | {} | 
|---|
| 110 |  | 
|---|
| 111 | template <> | 
|---|
| 112 | RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::normal_distribution<> >:: | 
|---|
| 113 | RandomNumberDistribution_Encapsulation(const RandomNumberDistribution_Parameters&_params) : | 
|---|
| 114 | distribution_type(_params.mean, _params.sigma) | 
|---|
| 115 | {} | 
|---|
| 116 |  | 
|---|
| 117 | template <> | 
|---|
| 118 | RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::lognormal_distribution<> >:: | 
|---|
| 119 | RandomNumberDistribution_Encapsulation(const RandomNumberDistribution_Parameters&_params) : | 
|---|
| 120 | distribution_type(_params.mean, _params.sigma) | 
|---|
| 121 | {} | 
|---|
| 122 |  | 
|---|
| 123 | /* ===============  min() ======================= */ | 
|---|
| 124 |  | 
|---|
| 125 | template <> | 
|---|
| 126 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::uniform_smallint<> >::min() const | 
|---|
| 127 | { | 
|---|
| 128 | return distribution_type.min(); | 
|---|
| 129 | } | 
|---|
| 130 |  | 
|---|
| 131 | template <> | 
|---|
| 132 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::uniform_int<> >::min() const | 
|---|
| 133 | { | 
|---|
| 134 | return distribution_type.min(); | 
|---|
| 135 | } | 
|---|
| 136 |  | 
|---|
| 137 | template <> | 
|---|
| 138 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::uniform_01<> >::min() const | 
|---|
| 139 | { | 
|---|
| 140 | return distribution_type.min(); | 
|---|
| 141 | } | 
|---|
| 142 |  | 
|---|
| 143 | template <> | 
|---|
| 144 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::uniform_real<> >::min() const | 
|---|
| 145 | { | 
|---|
| 146 | return distribution_type.min(); | 
|---|
| 147 | } | 
|---|
| 148 |  | 
|---|
| 149 | template <> | 
|---|
| 150 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::bernoulli_distribution<> >::min() const | 
|---|
| 151 | { | 
|---|
| 152 | return 0.; | 
|---|
| 153 | } | 
|---|
| 154 |  | 
|---|
| 155 | template <> | 
|---|
| 156 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::binomial_distribution<> >::min() const | 
|---|
| 157 | { | 
|---|
| 158 | return 0.; | 
|---|
| 159 | } | 
|---|
| 160 |  | 
|---|
| 161 | template <> | 
|---|
| 162 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::cauchy_distribution<> >::min() const | 
|---|
| 163 | { | 
|---|
| 164 | return std::numeric_limits<double>::min(); | 
|---|
| 165 | } | 
|---|
| 166 |  | 
|---|
| 167 | template <> | 
|---|
| 168 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::gamma_distribution<> >::min() const | 
|---|
| 169 | { | 
|---|
| 170 | return 0.; | 
|---|
| 171 | } | 
|---|
| 172 |  | 
|---|
| 173 | template <> | 
|---|
| 174 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::poisson_distribution<> >::min() const | 
|---|
| 175 | { | 
|---|
| 176 | return 0.; | 
|---|
| 177 | } | 
|---|
| 178 |  | 
|---|
| 179 | template <> | 
|---|
| 180 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::geometric_distribution<> >::min() const | 
|---|
| 181 | { | 
|---|
| 182 | return 0.; | 
|---|
| 183 | } | 
|---|
| 184 |  | 
|---|
| 185 | template <> | 
|---|
| 186 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::triangle_distribution<> >::min() const | 
|---|
| 187 | { | 
|---|
| 188 | return distribution_type.a(); | 
|---|
| 189 | } | 
|---|
| 190 |  | 
|---|
| 191 | template <> | 
|---|
| 192 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::exponential_distribution<> >::min() const | 
|---|
| 193 | { | 
|---|
| 194 | return 0.; | 
|---|
| 195 | } | 
|---|
| 196 |  | 
|---|
| 197 | template <> | 
|---|
| 198 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::normal_distribution<> >::min() const | 
|---|
| 199 | { | 
|---|
| 200 | return std::numeric_limits<double>::min(); | 
|---|
| 201 | } | 
|---|
| 202 |  | 
|---|
| 203 | template <> | 
|---|
| 204 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::lognormal_distribution<> >::min() const | 
|---|
| 205 | { | 
|---|
| 206 | return 0.; | 
|---|
| 207 | } | 
|---|
| 208 |  | 
|---|
| 209 | /* ===============  max() ======================= */ | 
|---|
| 210 |  | 
|---|
| 211 | template <> | 
|---|
| 212 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::uniform_smallint<> >::max() const | 
|---|
| 213 | { | 
|---|
| 214 | return distribution_type.max(); | 
|---|
| 215 | } | 
|---|
| 216 |  | 
|---|
| 217 | template <> | 
|---|
| 218 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::uniform_int<> >::max() const | 
|---|
| 219 | { | 
|---|
| 220 | return distribution_type.max(); | 
|---|
| 221 | } | 
|---|
| 222 |  | 
|---|
| 223 | template <> | 
|---|
| 224 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::uniform_01<> >::max() const | 
|---|
| 225 | { | 
|---|
| 226 | return distribution_type.max(); | 
|---|
| 227 | } | 
|---|
| 228 |  | 
|---|
| 229 | template <> | 
|---|
| 230 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::uniform_real<> >::max() const | 
|---|
| 231 | { | 
|---|
| 232 | return distribution_type.max(); | 
|---|
| 233 | } | 
|---|
| 234 |  | 
|---|
| 235 | template <> | 
|---|
| 236 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::bernoulli_distribution<> >::max() const | 
|---|
| 237 | { | 
|---|
| 238 | return 1.; | 
|---|
| 239 | } | 
|---|
| 240 |  | 
|---|
| 241 | template <> | 
|---|
| 242 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::binomial_distribution<> >::max() const | 
|---|
| 243 | { | 
|---|
| 244 | return distribution_type.t(); | 
|---|
| 245 | } | 
|---|
| 246 |  | 
|---|
| 247 | template <> | 
|---|
| 248 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::cauchy_distribution<> >::max() const | 
|---|
| 249 | { | 
|---|
| 250 | return std::numeric_limits<double>::max(); | 
|---|
| 251 | } | 
|---|
| 252 |  | 
|---|
| 253 | template <> | 
|---|
| 254 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::gamma_distribution<> >::max() const | 
|---|
| 255 | { | 
|---|
| 256 | return std::numeric_limits<double>::max(); | 
|---|
| 257 | } | 
|---|
| 258 |  | 
|---|
| 259 | template <> | 
|---|
| 260 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::poisson_distribution<> >::max() const | 
|---|
| 261 | { | 
|---|
| 262 | return std::numeric_limits<double>::max(); | 
|---|
| 263 | } | 
|---|
| 264 |  | 
|---|
| 265 | template <> | 
|---|
| 266 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::geometric_distribution<> >::max() const | 
|---|
| 267 | { | 
|---|
| 268 | return std::numeric_limits<double>::max(); | 
|---|
| 269 | } | 
|---|
| 270 |  | 
|---|
| 271 | template <> | 
|---|
| 272 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::triangle_distribution<> >::max() const | 
|---|
| 273 | { | 
|---|
| 274 | return distribution_type.c(); | 
|---|
| 275 | } | 
|---|
| 276 |  | 
|---|
| 277 | template <> | 
|---|
| 278 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::exponential_distribution<> >::max() const | 
|---|
| 279 | { | 
|---|
| 280 | return std::numeric_limits<double>::max(); | 
|---|
| 281 | } | 
|---|
| 282 |  | 
|---|
| 283 | template <> | 
|---|
| 284 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::normal_distribution<> >::max() const | 
|---|
| 285 | { | 
|---|
| 286 | return std::numeric_limits<double>::max(); | 
|---|
| 287 | } | 
|---|
| 288 |  | 
|---|
| 289 | template <> | 
|---|
| 290 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::lognormal_distribution<> >::max() const | 
|---|
| 291 | { | 
|---|
| 292 | return std::numeric_limits<double>::max(); | 
|---|
| 293 | } | 
|---|
| 294 |  | 
|---|
| 295 | /* ===============  p() ======================= */ | 
|---|
| 296 |  | 
|---|
| 297 | template <> | 
|---|
| 298 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::bernoulli_distribution<> >::p() const | 
|---|
| 299 | { | 
|---|
| 300 | return distribution_type.p(); | 
|---|
| 301 | } | 
|---|
| 302 |  | 
|---|
| 303 | template <> | 
|---|
| 304 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::binomial_distribution<> >::p() const | 
|---|
| 305 | { | 
|---|
| 306 | return distribution_type.p(); | 
|---|
| 307 | } | 
|---|
| 308 |  | 
|---|
| 309 | template <> | 
|---|
| 310 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::geometric_distribution<> >::p() const | 
|---|
| 311 | { | 
|---|
| 312 | return distribution_type.p(); | 
|---|
| 313 | } | 
|---|
| 314 |  | 
|---|
| 315 |  | 
|---|
| 316 | /* ===============  t() ======================= */ | 
|---|
| 317 |  | 
|---|
| 318 | template <> | 
|---|
| 319 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::binomial_distribution<> >::t() const | 
|---|
| 320 | { | 
|---|
| 321 | return distribution_type.t(); | 
|---|
| 322 | } | 
|---|
| 323 |  | 
|---|
| 324 | /* ===============  median() ======================= */ | 
|---|
| 325 |  | 
|---|
| 326 | template <> | 
|---|
| 327 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::cauchy_distribution<> >::median() const | 
|---|
| 328 | { | 
|---|
| 329 | return distribution_type.median(); | 
|---|
| 330 | } | 
|---|
| 331 |  | 
|---|
| 332 | /* ===============  sigma() ======================= */ | 
|---|
| 333 |  | 
|---|
| 334 | template <> | 
|---|
| 335 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::cauchy_distribution<> >::sigma() const | 
|---|
| 336 | { | 
|---|
| 337 | return distribution_type.sigma(); | 
|---|
| 338 | } | 
|---|
| 339 |  | 
|---|
| 340 | template <> | 
|---|
| 341 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::normal_distribution<> >::sigma() const | 
|---|
| 342 | { | 
|---|
| 343 | return distribution_type.sigma(); | 
|---|
| 344 | } | 
|---|
| 345 |  | 
|---|
| 346 | template <> | 
|---|
| 347 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::lognormal_distribution<> >::sigma() const | 
|---|
| 348 | { | 
|---|
| 349 | return distribution_type.sigma(); | 
|---|
| 350 | } | 
|---|
| 351 |  | 
|---|
| 352 | /* ===============  alpha() ======================= */ | 
|---|
| 353 |  | 
|---|
| 354 | template <> | 
|---|
| 355 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::gamma_distribution<> >::alpha() const | 
|---|
| 356 | { | 
|---|
| 357 | return distribution_type.alpha(); | 
|---|
| 358 | } | 
|---|
| 359 |  | 
|---|
| 360 |  | 
|---|
| 361 | /* ===============  mean() ======================= */ | 
|---|
| 362 |  | 
|---|
| 363 | template <> | 
|---|
| 364 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::poisson_distribution<> >::mean() const | 
|---|
| 365 | { | 
|---|
| 366 | return distribution_type.mean(); | 
|---|
| 367 | } | 
|---|
| 368 |  | 
|---|
| 369 | template <> | 
|---|
| 370 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::normal_distribution<> >::mean() const | 
|---|
| 371 | { | 
|---|
| 372 | return distribution_type.mean(); | 
|---|
| 373 | } | 
|---|
| 374 |  | 
|---|
| 375 | template <> | 
|---|
| 376 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::lognormal_distribution<> >::mean() const | 
|---|
| 377 | { | 
|---|
| 378 | return distribution_type.mean(); | 
|---|
| 379 | } | 
|---|
| 380 |  | 
|---|
| 381 | /* ===============  a() ======================= */ | 
|---|
| 382 |  | 
|---|
| 383 | template <> | 
|---|
| 384 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::triangle_distribution<> >::a() const | 
|---|
| 385 | { | 
|---|
| 386 | return distribution_type.a(); | 
|---|
| 387 | } | 
|---|
| 388 |  | 
|---|
| 389 |  | 
|---|
| 390 | /* ===============  b() ======================= */ | 
|---|
| 391 |  | 
|---|
| 392 | template <> | 
|---|
| 393 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::triangle_distribution<> >::b() const | 
|---|
| 394 | { | 
|---|
| 395 | return distribution_type.b(); | 
|---|
| 396 | } | 
|---|
| 397 |  | 
|---|
| 398 |  | 
|---|
| 399 | /* ===============  c() ======================= */ | 
|---|
| 400 |  | 
|---|
| 401 | template <> | 
|---|
| 402 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::triangle_distribution<> >::c() const | 
|---|
| 403 | { | 
|---|
| 404 | return distribution_type.c(); | 
|---|
| 405 | } | 
|---|
| 406 |  | 
|---|
| 407 |  | 
|---|
| 408 | /* ===============  lambda() ======================= */ | 
|---|
| 409 |  | 
|---|
| 410 | template <> | 
|---|
| 411 | double RandomNumberDistribution_Encapsulation< boost::exponential_distribution<> >::lambda() const | 
|---|
| 412 | { | 
|---|
| 413 | return distribution_type.lambda(); | 
|---|
| 414 | } | 
|---|
| 415 |  | 
|---|
| 416 |  | 
|---|